Przedsiębiorstwo Pepees powstało w 1960 roku, wtedy jako Zakład Przemysłu Ziemniaczanego w Łomży. W latach siedemdziesiątych działalność zakładów poszerzono o produkcję pasz. W połowie lat 90 XX wieku przystąpiono do Programu Powszechnej Prywatyzacji, a w 1996 roku zmieniono nazwę na Przedsiębiorstwo Przemysłu Spożywczego PEPEES S.A. Rok później akcje spółki debiutowały na warszawskiej Giełdzie Papierów Wartościowych.
Grupa PEPEES to stale rozwijająca się grupa kapitałowa, wyspecjalizowana w przetwórstwie ziemniaków w celu produkcji glukozy krystalicznej, grysiku, płatków ziemniaczanych oraz skrobi ziemniaczanej. Przedsiębiorstwo posiada największy w Polsce zakład przetwórstwa ziemniaka skrobiowego.